生物情報基盤構築チーム
チームヘッド
横田 秀夫

- 略歴
- 1993
- 神奈川科学技術アカデミー 樋口「極限メカトロニクス」開発チーム 専任研究員
- 1999
- 東京大学大学院工学系研究科 博士学位取得
- 1993
- 理化学研究所 生体力学シミュレーション特別研究チーム 協力研究員
- 2003
- 同 ものつくり情報技術統合化プログラムVCAT開発チーム チームリーダー
- 2006
- 同 VCADシステム研究プログラム 生物基盤構築チーム チームリーダー
- 2007
- 同 次世代計算科学研究開発プログラム 細胞スケール研究開発チーム チームリーダー(現職)
- 2010
- 同 生物情報基盤構築チーム チームヘッド(現職)
- 2010
- 神戸大学大学院工学研究科 客員教授(現職)
- 2011
- 北海道大学大学院工学研究院 客員教授(現職)
- 2011
- 東海大学総合医学研究所循環器内科学 客員教授(現職)
- 2011
- 東京農工大学大学院工学府 客員教授(現職)
研究概要
当チームでは、理化学研究所オリジナルな情報処理技術の開発、多次元の計測技術の開発により、生命現象の解明に貢献することを目的とする。
特に、新規の情報処理技術、画像処理技術の研究開発により、理化学研究所内外の研究者に向けた、生命現象を定量化する新規ツールを確立することにより、数理生物学、バイオメディカルシミュレーション、医療診断・治療技術の向上に貢献する。
最近の研究成果

- 図1 新規アルゴリズムと統合ソフトウエア開発
主要論文
- K. Fujisaki, et al. Three-Dimensional Microscopic Elemental Analysis Using an Automated High-Precision Serial Sectioning System, Microsc. Microanal. 2011, 17, 246.
- T. Ijiri, H. Yokota, Contour-based Interface for Refining Volume Segmentation, Computer Graphics Forum 2010, 29, 2153.
- K. Maeshima, et al. Nuclear Pore Formation, but Not Nuclear Growth, is Governed by Cyclin-dependent Kinases (Cdks) During Interphase in Human Dividing Cells, Nature Struct. Mol Biol. 2010, 17, 1065.
- S. Yoshizawa, A. Belyaev, H. Yokota, Fast Gauss Bilateral Filtering, Computer Graphics Forum: The International Journal of Eurographics Association 2010, 29, 60.
- K. Fujisaki, et al. Observation of three-dimensional internal structure of steel materials by means of serial sectioning with ultrasonic elliptical vibration cutting, J Microsc. 2010, 237, 89.
- K. Fujisaki, et al. Development of ultra-fine-grain binderless cBN tool for precision cutting of ferrous materials, J. Mater. Processing Technol. 2009, 209, 5646.
- S. Takemoto, H. Yokota, T. Mishima, R. Himeno, Segmentation of Anatomical Structure by Using a Local Classifier Derived from Neighborhood Information, Human-Computer Systems Interaction, Series: Advances in Intelligent and Soft Computing, 2009, 60, 171.
- S. Yoshizawa, et al. Intracellular Volume Registration, International Conference on Intelligent Systems Design and Applications, 2009, 1407.
- S. Takemoto, H. Yokota, Algorithm Selection for Intracellular Image Segmentation based on Region Similarity, International Conference on Intelligent Systems Design and Applications, 2009, 1413.
- T. Ijiri, K. Takayama, H. Yokota, T. Igarashi, ProcDef: Local-to-global Deformation for Skeleton-free Character Animation, Computer Graphics Forum: The International Journal of Eurographics Association (Proc. of Pacific Graphics) 2009, 28, 1821.
主要メンバー
| 主宰者 |
|
|
add |
delete |
| 横田 秀夫 |
Hideo Yokota |
チームヘッド |
|
|
| ポスドク |
|
|
add |
delete |
| 吉澤 信 |
Shin Yoshizawa |
協力研究員 |
|
|
| 金内-竹本 智子 |
Satoko Kanauchi-Takemoto |
特別研究員 |
|
|
| 井尻 敬 |
Takashi Ijiri |
特別研究員 |
|
|
| 中村 篤人 |
Shigeto Nakamura |
特別研究員 |
|
|
| 学生・研究生 |
|
|
add |
delete |
| 菱田 寛之 |
Hiroyuki Hishida |
大学院生リサーチ・アソシエイト |
|
|
| 技術系アシスタント |
|
|
add |
delete |
| 中村 佐紀子 |
Sakiko Nakamura |
テクニカルスタッフⅠ |
|
|
| 辻村 有紀 |
Yuki Tsujimura |
テクニカルスタッフⅠ |
|
|
| 西村 将臣 |
Masaomi Nishimura |
テクニカルスタッフⅠ |
|
|