生物情報基盤構築チーム

チームヘッド

横田 秀夫

  • Hideo Yokota
  • 博士(工学)
  • 横田 秀夫
  • 略歴
    1993
    神奈川科学技術アカデミー 樋口「極限メカトロニクス」開発チーム 専任研究員
    1999
    東京大学大学院工学系研究科 博士学位取得
    1993
    理化学研究所 生体力学シミュレーション特別研究チーム 協力研究員
    2003
    同 ものつくり情報技術統合化プログラムVCAT開発チーム チームリーダー
    2006
    同 VCADシステム研究プログラム 生物基盤構築チーム チームリーダー
    2007
    同 次世代計算科学研究開発プログラム 細胞スケール研究開発チーム チームリーダー(現職)
    2010
    同 生物情報基盤構築チーム チームヘッド(現職)
    2010
    神戸大学大学院工学研究科 客員教授(現職)
    2011
    北海道大学大学院工学研究院 客員教授(現職)
    2011
    東海大学総合医学研究所循環器内科学 客員教授(現職)
    2011
    東京農工大学大学院工学府 客員教授(現職)

研究概要

生物情報基盤構築チーム

当チームでは、理化学研究所オリジナルな情報処理技術の開発、多次元の計測技術の開発により、生命現象の解明に貢献することを目的とする。

特に、新規の情報処理技術、画像処理技術の研究開発により、理化学研究所内外の研究者に向けた、生命現象を定量化する新規ツールを確立することにより、数理生物学、バイオメディカルシミュレーション、医療診断・治療技術の向上に貢献する。

最近の研究成果

新規アルゴリズムと統合ソフトウエア開発
図1 新規アルゴリズムと統合ソフトウエア開発

主要論文

  1. K. Fujisaki, et al. Three-Dimensional Microscopic Elemental Analysis Using an Automated High-Precision Serial Sectioning System, Microsc. Microanal. 2011, 17, 246.
  2. T. Ijiri, H. Yokota, Contour-based Interface for Refining Volume Segmentation, Computer Graphics Forum 2010, 29, 2153.
  3. K. Maeshima, et al. Nuclear Pore Formation, but Not Nuclear Growth, is Governed by Cyclin-dependent Kinases (Cdks) During Interphase in Human Dividing Cells, Nature Struct. Mol Biol. 2010, 17, 1065.
  4. S. Yoshizawa, A. Belyaev, H. Yokota, Fast Gauss Bilateral Filtering, Computer Graphics Forum: The International Journal of Eurographics Association 2010, 29, 60.
  5. K. Fujisaki, et al. Observation of three-dimensional internal structure of steel materials by means of serial sectioning with ultrasonic elliptical vibration cutting, J Microsc. 2010, 237, 89.
  6. K. Fujisaki, et al. Development of ultra-fine-grain binderless cBN tool for precision cutting of ferrous materials, J. Mater. Processing Technol. 2009, 209, 5646.
  7. S. Takemoto, H. Yokota, T. Mishima, R. Himeno, Segmentation of Anatomical Structure by Using a Local Classifier Derived from Neighborhood Information, Human-Computer Systems Interaction, Series: Advances in Intelligent and Soft Computing, 2009, 60, 171.
  8. S. Yoshizawa, et al. Intracellular Volume Registration, International Conference on Intelligent Systems Design and Applications, 2009, 1407.
  9. S. Takemoto, H. Yokota, Algorithm Selection for Intracellular Image Segmentation based on Region Similarity, International Conference on Intelligent Systems Design and Applications, 2009, 1413.
  10. T. Ijiri, K. Takayama, H. Yokota, T. Igarashi, ProcDef: Local-to-global Deformation for Skeleton-free Character Animation, Computer Graphics Forum: The International Journal of Eurographics Association (Proc. of Pacific Graphics) 2009, 28, 1821.

主要メンバー

主宰者 add delete
横田 秀夫 Hideo Yokota チームヘッド    
スタッフ研究員 add delete
ポスドク add delete
吉澤 信 Shin Yoshizawa 協力研究員    
金内-竹本 智子 Satoko Kanauchi-Takemoto 特別研究員    
井尻 敬 Takashi Ijiri 特別研究員    
中村 篤人 Shigeto Nakamura 特別研究員    
学生・研究生 add delete
菱田 寛之 Hiroyuki Hishida 大学院生リサーチ・アソシエイト    
技術系アシスタント add delete
中村 佐紀子 Sakiko Nakamura テクニカルスタッフⅠ    
辻村 有紀 Yuki Tsujimura テクニカルスタッフⅠ    
西村 将臣 Masaomi Nishimura テクニカルスタッフⅠ    
事務系アシスタント add delete
客員研究員・客員技師 add delete
その他のスタッフ add delete
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