糖鎖構造生物学研究チーム

チームリーダー

山口 芳樹

  • Yoshiki Yamaguchi
  • 博士（薬学）
  • 山口 芳樹
  • 略歴
    1998
    東京大学大学院薬学系研究科機能薬学専攻 博士課程修了
    1998
    日本学術振興会 特別研究員
    2000
    東京大学薬学部 助手
    2001
    名古屋市立大学大学院薬学研究科 講師
    2007
    理化学研究所 糖鎖構造生物学研究チーム チームリーダー（現職）
    2007
    名古屋市立大学大学院薬学研究科 客員教授（現職）
    2008
    東京医科歯科大学大学院生命情報科学教育部 連携教授（現職）

研究概要

糖鎖構造生物学研究チーム

タンパク質に結合している糖鎖の機能を解明するためには、糖鎖を立体構造の観点から捉えることが重要になる。当チームは、糖タンパク質や糖鎖関連タンパク質の立体構造を明らかにして、糖鎖のもつ機能に迫る。合成化学的手法や細胞工学的手法を用いて糖鎖・糖タンパク質を調製し、NMRやX 線結晶解析等の物理化学的手法により立体構造解析を行っていく。さらに、バイオインフォマティクスの技術を用いて糖鎖の立体構造のデータベース構築を行い、その立体構造情報から糖鎖のもつシグナルの解読を目指す。特に、タンパク質・糖鎖の変異による疾患の発症メカニズムを立体構造の観点から明らかにして、診断薬・治療薬のデザインと開発を進めていく。

最近の研究成果

糖タンパク質糖鎖の立体構造データベースの構築とその解析
図1 糖タンパク質糖鎖の立体構造データベースの構築とその解析

主要論文

  1. M. Kanagawa, T. Satoh, A. Ikeda, Y. Nakano, H. Yagi, K. Kato, K. Kojima-Aikawa, Y. Yamaguchi, Crystal structures of human secretory proteins ZG16p and ZG16b reveal a Jacalin-related β-prism fold, Biochem. Biophys. Res. Commun. 2011, 404, 201.
  2. T. Satoh, Y. Chen, D. Hu, S. Hanashima, K. Yamamoto, Y. Yamaguchi, Structural basis for oligosaccharide recognition of misfolded glycoproteins by OS-9 in ER-associated degradation, Molecular Cell 2010, 40, 905.
  3. Y. Yamaguchi, K. Kato, Dynamics and interactions of glycoconjugates probed by stable-isotope-assisted NMR spectroscopy, Methods Enzymol. 2010, 478, 305.
  4. K. Kato, Y. Yamaguchi, Y. Arata, Stable-isotope-assisted NMR approaches to glycoproteins using immunoglobulin G as a model system, Prog. NMR Spect. 2010, 56, 346.
  5. S. Hanashima, K. Sato, Y. Naito, H. Takematsu, Y. Kozutsumi, Y. Ito, Yamaguchi Y, Synthesis and binding analysis of unique AG2 pentasaccharide to human Siglec-2 using NMR techniques, Bioorg. Med. Chem. 2010, 18, 3720.
  6. S. Sato, O. Morohara, D. Fujita, Y. Yamaguchi, K. Kato, M. Fujita, Parallel-stacked aromatic hosts for orienting small molecules in a magnetic field: induced residual dipolar coupling by encapsulation, J. Am. Chem. Soc. 2010, 132, 3670.
  7. M. Fujita, Y. Maeda, M. Ra, Y. Yamaguchi, R. Taguchi, T. Kinoshita, GPI glycan remodeling by PGAP5 regulates transport of GPI-anchored proteins from the ER to the Golgi, Cell 2009, 139, 352.
  8. S. Hanashima, K. Sato, Y. Ito, Y. Yamaguchi, Silylene/oxazolidinone double-locked sialic acid building blocks for the efficient sialylation reaction in dichloromethane, Eur. J. Org. Chem. 2009, 4215.
  9. S. Hanashima, K. Sato, Y. Ito, Y. Yamaguchi, Synthesis of the Starfish Ganglioside AG2 Pentasaccharide, Tetrahedron Lett. 2009, 50, 6150.
  10. Y. Yamaguchi, M. Wälchli, M. Nagano, K. Kato, A 13C-detection NMR approach for large glycoproteins, Carbohydr. Res. 2009, 344, 535.

主要メンバー

主宰者 add delete
山口 芳樹 Yoshiki Yamaguchi チームリーダー    
スタッフ研究員 add delete
花島 慎弥 Shinya Hanashima 基幹研究所研究員    
金川 真由美 Mayumi Kanagawa 基幹研究所研究員    
長江 雅倫 Masamichi Nagae 基幹研究所研究員    
ポスドク add delete
学生・研究生 add delete
ガネーシャ・プラサド・スベディ Ganesh Prasad Subedi 国際プログラム・アソシエイト    
技術系アシスタント add delete
加藤 雅樹 Masaki Kato テクニカルスタッフⅠ    
池田 明美 Akemi Ikeda テクニカルスタッフⅠ    
菅 秋次 Akitsugu Suga テクニカルスタッフⅠ    
事務系アシスタント add delete
客員研究員・客員技師 add delete
林 雄太郎 Yutaro Hayashi 客員主管研究員    
その他のスタッフ add delete
鵜澤 洵 Jun Uzawa 研究支援パートタイマー    
田中 典子 Noriko Tanaka 研究補助パートタイマー    
松本 加奈 Kana Matsumoto 派遣職員    
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