分子リガンド探索研究チーム

チームリーダー

吉田 稔

  • Minoru Yoshida
  • 農学博士
  • 吉田 稔
  • 略歴
    1986
    東京大学大学院農学系研究科農芸化学専攻 博士課程修了
    1986
    東京大学農学部 助手
    1995
    同 助教授
    2002
    理化学研究所 化学遺伝学研究室 主任研究員（現職）
    2002
    東京大学 客員教授（現職）
    2003
    埼玉大学 客員教授（現職）
    2008
    理化学研究所 ケミカルゲノミクス研究グループ グループディレクター（現職）
    2011
    京都大学 客員教授（現職）

研究概要

分子リガンド探索研究チーム

ケミカルバイオロジーのアプローチにより、様々な生命現象を理解し、それを人為的に制御するためには、ユニークな活性を持つ新たな小分子リガンドの開発が必須である。そこで当チームは、化合物ライブラリーから生命科学の進展に貢献可能な新しい分子リガンドの発見を目指す。具体的には、 培養動物細胞や酵母を用いた表現型スクリーニング系、あるいはタンパク質翻訳後修飾等を標的としたin vitroスクリーニング系を構築し、探索研究を行う。さらに標的タンパク質に対する分子リガンドのin silicoスクリーニングと最適化を行うための基盤研究を行う。その結果、新しい翻訳後修飾の阻害剤探索系を確立し、これまで阻害剤が知られていなかったSUMO化の阻害剤を発見するなどの成果を挙げた。

最近の研究成果

生細胞内でヒストンH4K12アセチル化を観察可能な蛍光プローブHistac-K12を用いたヒストンアセチル化のライブ映像
図1 生細胞内でヒストンH4K12アセチル化を観察可能な蛍光プローブHistac-K12を用いたヒストンアセチル化のライブ映像
生細胞に発現させたHiatac-K12を用いて、ヒストン脱アセチル化酵素阻害剤に応答したヒストンH4K12のアセチル化レベルの変化を疑似カラーで表示した。本プローブによって生細胞内のヒストンH4K12アセチル化レベルの動態解析だけでなく、ヒストンアセチル化を標的とした薬剤の評価、スクリーニングが可能になった。

主要論文

  1. T. Ito, et al. Real-time imaging of histone H4K12-specific acetylation determines the modes of action of histone deacetylase and bromodomain inhibitors, Chem. Biol. 2011, 18, 495.
  2. S. Nishimura, et al. Marine antifungal theonellamides target 3β-hydroxysterol to activate Rho1 signaling, Nature Chem. Biol. 2010, 6, 519.
  3. Y. Yashiroda, et al. A novel yeast cell-based screen identifies flavone as a tankyrase inhibitor, Biochem. Biophys. Res. Commun. 2010, 394, 569.
  4. N. M. Islam, et al. Bicyclic peptides as potent inhibitors of histone deacetylases: Optimization of alkyl loop length, Bioorg. Med. Chem. Lett. 2010, 20, 997.
  5. A. Matsuyama, M. Yoshida, Systematic cloning of an ORFeome using the gateway system, Methods Mol. Biol. 2009, 577, 11.
  6. I. Fukuda, et al. Kerriamycin B inhibits protein SUMOylation, J. Antibiotics 2009, 62, 221.
  7. I. Fukuda, et al. Ginkgolic acid Inhibits protein SUMOylation by blocking formation of the E1-SUMO intermediate, Chem. Biol. 2009, 16, 133.
  8. N. Nishino, et al. Interaction of aliphatic cap group in inhibition of histone deacetylases by cyclic tetrapeptides, Bioorg. Med. Chem. 2008, 16, 437.
  9. A. Suenaga, et al. Estimation of ligand binding free energies of F-ATPase by using molecular dynamics/free energy calculation, J. Comp. Chem. Jp. 2008, 7, 103.
  10. Y. Yashiroda, A. Matsuyama, M. Yoshida, New insights into chemical biology from ORFeome libraries, Curr. Opin. Chem. Biol. 2008, 12, 55.

主要メンバー

主宰者 add delete
吉田 稔 Minoru Yoshida チームリーダー（ケミカルゲノミクス研究グループ グループディレクター）    
スタッフ研究員 add delete
張 永健 Kam Zhang （Zhang独立主幹研究ユニット 独立主幹研究員）    
堂前 直 Naoshi Dohmae （バイオ解析チーム チームヘッド）    
木川 隆則 Takanori Kigawa （生命分子システム基盤研究領域 副領域長） 　  
泰地 真弘人 Makoto Taiji （生命システム研究センター 生命モデリングコア コア長）    
小川 健司 Kenji Ogawa 専任研究員    
凌 楓 Feng Ling 専任研究員（吉田化学遺伝学研究室 専任研究員）    
古園 さおり Saori Kosono 専任研究員（吉田化学遺伝学研究室 専任研究員）    
宮武 秀行 Hideyuki Miyatake 専任研究員（バイオ解析チーム 専任研究員）    
松山 晃久 Akihisa Matsuyama 専任研究員（吉田化学遺伝学研究室専任研究員）    
八代田 陽子 Yoko Yashiroda 専任研究員（吉田化学遺伝学研究室 専任研究員）    
伊藤 昭博 Akihiro Ito 専任研究員（吉田化学遺伝学研究室 専任研究員）    
関戸 茂子 Shigeko Sekido 専任技師（吉田化学遺伝学研究室 専任技師）    
栃尾 尚哉 Naoya Tochio 研究員（生命分子システム基盤研究領域 ＮＭＲパイプライン高度化研究チーム 研究員）    
鈴木 健裕 Takehiro Suzuki 技師（バイオ解析チーム 技師）    
ポスドク add delete
小林 大貴 Hiroki Kobayashi 特別研究員    
徳光 綾子 Ayako Tokumitsu 特別研究員    
中嶋 佑一 Yuichi Nakajima 特別研究員    
竹本 靖 Yasushi Takemoto 訪問研究員    
学生・研究生 add delete
技術系アシスタント add delete
岡本 怜衣香 Reika Okamoto テクニカルスタッフⅠ    
廣濱 美香子 Mikako Hirohama テクニカルスタッフⅠ    
橋本 敦史 Atsushi Hashimoto テクニカルスタッフⅡ    
高 のえみ Noemi Ko テクニカルスタッフⅡ    
前田 里子 Satoko Maeda テクニカルスタッフⅡ    
牛 栄 Rong Niu テクニカルスタッフⅡ    
事務系アシスタント add delete
客員研究員・客員技師 add delete
その他のスタッフ add delete

（）は理研内本務先。

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