生体分子機能研究室

主任研究員

林崎 良英

  • Yoshihide Hayashizaki
  • 医学博士
  • 林崎 良英
  • 略歴
    1982
    大阪大学医学部医学科卒業 医師免許取得
    1986
    大阪大学医学部大学院博士課程内科系 博士学位取得
    1987
    国立循環器病センター研究所 研究員
    1992
    理化学研究所 ライフサイエンス筑波研究センター 研究員
    1995
    同 ゲノム科学研究室 主任研究員
    1998
    同 ゲノム科学総合研究センター 遺伝子構造・機能研究グループ プロジェクトディレクター
    1998
    同 中央研究所 生体分子機能研究室 主任研究員（兼務）
    2002
    横浜市立大学 客員教授（兼務）
    2003
    クイーンズランド大学（オーストラリア）客員教授（兼務）
    2008
    理化学研究所 オミックス基盤研究領域 領域長（現職）

研究概要

当研究室は、Functional Genomicsを理解するための基礎的な技術開発と遺伝子資源探索を進めてきた。その発展的活動であるマウスエンサイクロペディアプロジェクトは平成10年10月に発足したゲノム科学総合研究センター・遺伝子構造・機能研究グループに引き継がれ、現在当研究室ではより希少な発現遺伝子を網羅的に収集するための完全長cDNAライブラリー作成の技術開発・改良を行っている。例えば異なる機能をもつタンパク質を作り出す選択的スプライシングの解析技術、未知の遺伝子超長鎖mRNA(疾患遺伝子の多くが長鎖遺伝子)の収集技術、転写開始点を収集する技術の開発を中心に行っている。これら基礎技術は、疾患遺伝子の発見、創薬のターゲットとなる遺伝子の発見にも寄与し、産業化へも大きく貢献できる。また、これら開発した技術をもとに国内外の様々な研究機関と多くの共同研究を行っている。なかでも、遺伝子構造・機能研究グループとの共同研究であるゲノムネットワークプロジェクトにおいては、その基盤となるデータの網羅的創出を目指し、当研究室で開発された転写開始点解析技術をハイスループット化し、転写開始点、発現制御エレメントの網羅的収集並びに解析に大きく貢献している。

主要論文

  1. Y. Mitani, et al. Rapid SNP diagnostics using asymmetric isothermal amplification and a new mismatch-suppression technology, Nat Methods. 2007, 4(3), 257.
  2. P. Carninci, et al. Genome-wide analysis of mammalian promoter architecture and evolution, Nat Genet. 2006, 38, 626.
  3. The FANTOM Consortium, RIKEN Genome Exploration Research Group and Genome Science Group (Genome Network Project Core Group), The Transcriptional Landscape of the Mammalian Genome, Science 2005, 309, 1559.
  4. RIKEN Genome Exploration Research Group and Genome Science Group (Genome Network Project Core Group) and the FANTOM Consortium, Antisense Transcription in the Mammalian Transcriptome, Science 2005, 309, 1564.
  5. T. Shiraki, et al. Cap analysis gene expression for high-throughput analysis of transcriptional starting point and identification of promoter usage, Proc. Natl Acad. Sci. USA 2003, 100, 15776.
  6. The FANTOM Consortium and The RIKEN Genome Exploration Research Group Phase I & II Team, Analysis of the mouse transcriptome based on functional annotation of 60,770 full-length cDNA, Nature 2002, 420, 563.
  7. The RIKEN Genome Exploration Research Group Phase II Team and the FANTOM Consortium, Functional annotation of 21,076 sequenced mouse cDNAs prepared from full-length enriched libraries, Nature 2001, 409, 685.

主要メンバー

主宰者 add delete
林崎 良英 Yoshihide Hayashizaki 主任研究員（オミックス基盤研究領域 領域長）    
スタッフ研究員 add delete
河合 純 Jun Kawai 副主任研究員    
ピエロ・カルニンチ Piero Carninci 先任研究員    
伊藤 昌可 Masayoshi Ito 先任研究員    
ポスドク add delete
学生・研究生 add delete
技術系アシスタント add delete
事務系アシスタント add delete
客員研究員・客員技師 add delete
その他のスタッフ add delete

（）は理研内本務先。

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